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MLL-AF4融合基因定量检测
由t(4;11)易位产生,主要发生在婴儿，儿童少见，成人5-6%，阳性提示预后差，一般建议强化治疗。
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PML-RARα-V融合基因定量检测
PML-RARα是APL的特征性基因标记，95%的患者有该基因；指导用药方面，与ATRA的疗效密切相关；V型的发生率 10%,预后最差。
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SIL-TAL1融合基因定量检测
SIL-TAL1基因重排在T-ALL比较常见，是T-ALL预后不良的指标。
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TEL-AML1融合基因定量检测
主要见于儿童前B-ALL(25%),成人少见，T-ALL未见。
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ALK基因重排检测(淋巴瘤)
用于间变性大细胞淋巴瘤的辅助诊断和分类判断
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CDKN2A/CEP9 (9p21;9p11-9q11)检测
在ALL中提示预后差
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